Исполняющим обязанности главного врача Регионального перинатального центра стал заместитель главврача по акушерско-гинекологической помощи Вадим Лимаев. Соответствующие данные опубликованы на официальном сайте медицинского учреждения.

До переезда в Калининград кандидат медицинских наук с 36-летним стажем работы Вадим Лимаев работал в перинатальном центре города Ноябрьска в Ямало-Ненецком автономном округе.

С сентября 2021 года ГБУ Калининградской области «Региональный перинатальный центр» возглавлял Олег Седнев. В середине января 2024 года стало известно о его отставке по собственному желанию.

В конце декабря 2023 года более 70 врачей-неонатологов и акушеров-гинекологов калининградского перинатального центра обратились к президенту РФ с жалобой на невыплату федеральной субсидии за 2023 год «по причине достижения целевых показателей по оплате труда по дорожной карте». Обращение также направили в Фонд обязательного медицинского страхования, губернатору Антону Алиханову, в трудовую инспекцию и прокуратуру.

В обращении указано, что федеральные выплаты по 100 тыс. руб. были выплачены всем учреждениям родовспоможения и другим лечебным учреждениям Калининградской области, кроме ГБУ «Региональный перинатальный центр»: «Обращаем Ваше внимание на то, что показатели "дорожной карты" достигнуты благодаря низкой списочной численности основных сотрудников. Большая часть ставок заняты этими же сотрудниками по внутреннему совместительству <…> в связи с нарастающим дефицитом кадров. Средняя заработная плата врачей при этом составляет 50–60 тыс. руб.».

В региональном управлении СК РФ начали проверку по информации о невыплате зарплаты медикам перинатального центра («отдельные признаки преступления, предусмотренного ст. 145.1 УК РФ» («Невыплата заработной платы, пенсий, стипендий, пособий и иных выплат»). О ее результатах не сообщалось.

В правительстве Калининградской области утверждают, что зарплаты врачей перинатального центра «соответствуют целевым показателям по майским указам», поэтому им и не были выплачены деньги. Федеральные средства ушли больницам, которые не смогли обеспечить показатели, сообщили региональные власти в ответе на информационный запрос «Нового Калининграда».

По данным регионального минздрава, за 11 месяцев 2023 года средний размер зарплаты врачей Регионального перинатального центра составил 91,9 тыс. руб. (223,2 % к среднемесячному плановому доходу от трудовой деятельности в регионе).