Обещанный набор курсантов 1 курса в БВМИ не состоялся (по заявке пограничников набрано 20 человек), и согласно директиве Министерства Обороны РФ по выпуску лейтенантов в 2013 году институт будет расформирован. Школа техников переведена в один из российских городов, оставшийся курс, доучен в Кронштадте, собственно, это будет стажировка и дипломная работа.
В так называемом старом корпусе БВМИ в будущем разместится областное УВД, причем вместе с ГАИ и прочими подразделениями, а остальная территория предназначена под жилую застройку.