Калининградский институт экономики полностью лишён государственной аккредитации. Информация об этом размещена на официальном сайте Рособрнадзора. Приказ о лишении получен 27 ноября 2019 года. До этого с 17 сентября аккредитация была приостановлена, но информация об этом скрывалась от студентов.

В начале декабря начались увольнения преподавателей "по собственному желанию". Студентам раздали бланки заявлений о согласии учиться на неаккредитованных программам и о согласии получить диплом "негосударственного" образца. Одновременно руководство института попросило студентов немедленной оплаты весеннего семестра 2020 года. Наиболее продвинутые студенты начали переводиться в вузы, имеющие государственную аккредитацию и схожие программы обучения. Часть уже ушла в Балтийский Федеральный университет им. Канта, в Калининградский государственный технический университет, в Калининградский институт экономики - филиал Санкт-Петербургского университета технологий управления и экономики и в Полесский филиал Санкт-Петербургского аграрного университета.

Объявлено, что "очку" и выпускной курс "заочки" переведут в Калининградский институт экономики, как самый приемлемый по стоимости обучения. Остальные остаются "не при делах" или сами ищут вуз для перевода.