Калининградские перевозчики наиболее сильно пострадали от введения системы «Платон», так как, помимо платы по России, они также оплачивают пользование дорогами в Литве и Белоруссии при перевозке грузов на остальную территорию России. По расчетам главы комитета по транспорту Калининградской ТПП Леонида Степанюка, общий платеж за ущерб дорогам до повышения платежей в «Платон» составляет 12,2 тыс. руб. за круговой маршрут (Калининград – Москва – Калининград, 2500 км). За перевозку груза по территории России на то же расстояние перевозчики оплачивают в «Платон» 4 тыс. руб., или в 3 раза меньше.

С 15 апреля 2017 года при расчете платы в систему «Платон» за проезд автопоездов по федеральным трассам будет применяться коэффициент 0,82, вместо 0,41. Это означает, что фактически платеж за километр вырастет с 1,5 руб. до 3 руб.