Премьер-министр России Дмитрий Медведев утвердил новую редакцию программы развития БФУ им. И. Канта. Документ, содержащий основные приоритеты и направления деятельности федерального вуза, мероприятия и объёмы финансирования, был одобрен в 2011 году и рассчитан до 2020 года. Нынешние изменения в программе были приурочены к завершению первого этапа её реализации.

В документе не изменяли главное направление развития БФУ, которое связано с задачами социально-экономического развития региона. Приоритетными направлениями науки числятся: медицинские технологии и биотехнологии, материаловедение и наносистемы, информационно-телекоммуникационные системы, транспортно-логистические технологии, социальные изменения и социально-гуманитарные технологии, рациональное природопользование, технологии развития территорий, энергосбережение и энергетическая безопасность. Что касается объёмов финансирования, то показатели существенно не изменились. Общий объём обеспечения программы на 2011–2020 годы составит 6637 млн руб.

Особый акцент в новой программе развития вуза делается на целевые показатели, по которым в итоге можно будет судить об эффективности выполнения плана. Так, например, через 5 лет число публикаций исследователей в информационно-аналитической системе научного цитирования БФУ должно вырасти на 30–50 %. Также к этому сроку планируется увеличить зарплаты научно-педагогических работников, которые должны будут получать сумму в два раза больше, чем средняя заработная плата по региону. Среди остальных целевых показателей присутствует: рост численности молодых сотрудников, увеличение доходов от управления объектами интеллектуальной собственности, появление новых лабораторий и так далее.