Филиал ОАО «Российские железные дороги» получил порубочный билет на 545 деревьев и 26 кустарников в центре Калининграда за мемориалом 1200 воинам-гвардейцам, а также вдоль ул. Железнодорожной, Портовой и Буткова. Получателем разрешительного документа со сроком действия до 21 декабря 2023 года значится дирекция по комплексной реконструкции железных дорог и строительству объектов железнодорожного транспорта.

Вырубки из-за строительства дублера Двухъярусного моста будут вестись на земельных участках с номерами 39:15:000000:32, 39:15:000000:34, 39:15:151415:153 и 39:15:110603:872, а также земель в кадастровых кварталах, где государственная собственность не разграничена. Все они располагаются вдоль железнодорожных путей за парком Победы на Гвардейском проспекте и ул. Буткова и на правом берегу Преголи вдоль путей в сторону Южного вокзала. Перечетная ведомость на 673 дерева была составлена в августе 2020 года и подписана начальником отдела озеленения горадминистрации Дмитрием Петренко, ведущими инженерами «Калининградской службы заказчика» Кокоткиной и Сиротой. Под спил попадают клены, березы, дубы, каштаны, тополя, грабы, липы, ясени, яблони, сливы, боярышники и большое количество самосева с диаметром ствола до 20 см. Большинство деревьев находятся в удовлетворительном состоянии. 

Как следует из документа, подписанного зампредседателя комитета городского хозяйства администрации Калининграда Юрием Кондратьевым, сумма компенсационной стоимости за зеленые насаждения, попадающие под вырубку, составляет 8,98 млн руб. 

Проект компенсационного озеленения делала компания «Асгард». При этом в качестве компенсационного озеленения предусмотрены только 545 грабов в возрасте 12 лет и высотой 3,5 метра. Иных пород деревьев в качестве компенсации не планируется, несмотря на огромное разнообразие вырубаемых взрослых насаждений, которых лишится город. Посадки планируются частично на ул. Галицкого, однако это лишь 26 кустарников можжевельника высотой 50 см. Большая же часть посадок будет проведена на существенном удалении и вовсе не в зоне вокруг вырубки, а в районе Северного обхода на участке в кадастровом квартале 39:15:120505, где расположена новая дорога между автокластером «Автотора» и Люблинским шоссе. Такой подход мотивирован тем, что в границах отвода объекта строительства отсутствует место для выполнения компенсационного озеленения.